A külső szűrőt kívülről kell csatlakoztatni az akváriumhoz. 

A víz egy beömlő csővezetéken keresztül kerül bele. Miután a szűrő anyagai megfelelően megtisztították a vizet, azt szivattyú juttatja vissza az akváriumba. A külső szűrőben a legkülönfélébb szűrőanyagokat helyezhetjük el, például filcet, kerámiát vagy habszivacsot, ráadásul még a tartály belső teréből sem vesz el helyet.

Mindezek mellett a külső szűrő könnyebben karbantartható, és csak akkor kell megtisztítanunk, ha romlik a hatékonysága, ami rendszerint 2-4 havonta következik be. Ez esetben nincs más teendő, csak válasszuk le a külső szűrőt a vezetékeiről és mossuk el langyos víz alatt. A tisztításhoz használt víz hőmérséklete nagyjából feleljen meg az akvárium vízhőmérsékletének, hogy a szűrőben lévő baktériumok ne károsodjanak.